Henry, kepala biara biara Cistercian di Sedlec, dikirim ke Palestina (Tanah Suci) oleh Raja Otakar II dari Bohemia dalam 1278. Ketika ia kembali, ia membawa sejumlah kecil bumi ia disingkirkan dari Golgota dan ditaburkan di atas makam biara. Kata ini bertindak saleh segera menyebar dan makam di Sedlec menjadi lokasi kuburan yang diinginkan di seluruh Eropa Tengah. Selama Kematian Hitam pada pertengahan abad 14, dan setelah Perang Hussite pada awal abad ke-15, ribuan orang dimakamkan di sana dan pemakaman harus sangat diperbesar.Sekitar tahun 1400 sebuah gereja Gothic dibangun di tengah
kuburan dengan tingkat atas berkubah dan sebuah kapel yang lebih rendah untuk digunakan sebagai osuarium untuk kuburan massal digali selama konstruksi, atau hanya dijadwalkan untuk pembongkaran untuk memberikan ruang bagi penguburan baru. Setelah 1511 tugas exhuming kerangka dan tulang-tulang mereka menumpuk di kapel itu, menurut legenda, diberikan kepada seorang biarawan setengah buta pesanan.
Antara 1703 dan 1710 pintu masuk yang baru dibangun untuk mendukung dinding depan, yang bersandar luar, dan kapel atas dibangun kembali. Karya ini, dalam gaya Baroque Ceko, dirancang oleh Jan Santini Aichel.
Pada tahun 1870, FrantiĊĦek etak, pemahat kayu, adalah dipekerjakan oleh keluarga Schwarzenberg untuk menempatkan tumpukan tulang ke dalam urutan. Hasil mengerikan dari upaya-Nya berbicara untuk dirinya sendiri. Empat gundukan berbentuk lonceng besar menempati sudut-sudut kapel. Sebuah lampu gantung besar tulang, yang berisi setidaknya satu dari setiap tulang dalam tubuh manusia, tergantung dari pusat nave dengan mengalungkan untaian tengkorak kubah. Karya-karya lain termasuk dermaga dan monstrans mengapit altar, besar Schwarzenberg coat-of-senjata, dan tanda tangan dari etak, juga dilaksanakan di tulang, di dinding dekat pintu masuk.